Родилась 1 марта 1982 года в пос. Всеволодо-Вильва Пермской области. Окончила Соликамский Государственный Педагогический Институт, психологический факультет.
4 декабря 2011 года избрана депутатом Законодательного Собрания Пермского края второго созыва по партийным спискам от Пермского краевого отделения политической партии «Коммунистическая партия Российской Федерации».
В сентябре 2016 года вновь избрана депутатом Законодательного собрания.
Руководитель фракции «Коммунистическая партия Российской Федерации» в Законодательном Собрании Пермского края.
В ноябре 2017 года Ксения Айтакова была назначена исполняющей обязанности первого секретаря крайкома КПРФ, в мае 2018 года избрана на эту должность.
В феврале 2021 года переизбрана первым секретарем Пермского крайкома КПРФ.
В сентябре 2021 года избрана депутатом Законодательного собрания Пермского края IV созыва по партийному списку КПРФ. В октябре 2021 года избрана заместителем председателя регионального парламента. «За» избрание Ксении Айтаковой проголосовали 53 человека, один воздержался.